二元结构政策的局限日益显著。城乡二元体制把农村与城市截然划分为两个个体,同时以经济建设为首要任务的情况下,城市化、工业化进程急需加快,农村一直被冷落,与城市相比发展条件迥异。如农村劳动力难以自由流动,进城务工受歧视性政策的束缚,另外明显的一点是农民赋税远高于城镇居民。目前,财政、金融、教育等制度都不利于农村发展,如:90年代财政支农比重一直下降:1991--1997年分别为10.3%、10.0%、9.5%、9.2%、8.4%、8.8%、8.3%,政府对农民的直接补贴几乎为零。农民几乎不享有国家给与的任何福利,农民得了大病几乎倾家荡产。国家规定由九年义务教育,但农村义务教育主要靠向农民摊派,农家孩子读书基本靠自己尽义务,另外农村中小学适龄儿童的入学率大大低于城镇,农村学生辍学率、流失率高于城市,城乡教师工资也存在较大差别。